Napište odpovědi na všechny otázky (a vaše jméno) do obrázku z úlohy U1 a pošlete obrázek jako attachment e-mailem přednášejícímu.
Obrázek na začátku stránky je molekula isatin. V tomto cvičení s ní budete dělat několik úkonů. (Je to obrázek ve formátu GIF, takže nepotřebujete žádnou pomocnou aplikaci (plugin) k jeho zobrazení.)
U1. ISIS/Draw je velmi mocný a volně dostupný program pro kreslení, který může být používán ve spojení s Web prohlížečem k zobrazení některých MDL MIME typů. Je to také samostatný program, který vám umožňuje kreslit vzorce molekul.
Seznamte se s ISIS/Draw, jež je nainstalován např. na počítači v pokročilém praktiku a v počítačových učebnách. Podržte pravé tlačítko myši zmačknuté na každé ikoně nástroje (jsou po levé straně), všimněte si k čemu jsou určeny. Obvykle je to nástroj "vazba (bond)", který budete používat, pokud nebudete používat některý z předkreslených obrázků. Také se podívejte na velké množství templátů, ze kterých si můžete vybrat. Templát můžete vybrat kliknutím na jeden z uzlů v molekule (atom, křížení vazeb).
Nakreslete vzorec isatinu pomocí ISIS/Draw, označte jej v obrázku nápisem Isatin a uložte do souboru rovněž po jménem Isatin. Vytvořený soubor pošlete e-mailem instruktorovi jako přílohu (attachment).
Pokud používáte jiný program ke kreslení chemických vzorců, mužete ho použít místo ISIS/Draw.
U2. Při psaní článků pro publikaci ve vědeckých časopisech chemici nemohou jen kreslit obrázky molekul. Musí také molekuly pojmenovat. Nejčastěji se požaduje, aby název odpovídal doporučením IUPAC pro názvosloví. Program, který pomáhá při pojmenovávání organických sloučenin, je např. ACD Name, od firmy ACD Labs, nebo program Autonom od firmy MDL (dříve Beilstein). Autonom je nainstalován na počítačích v knihovně a pokročilém praktiku jako jedna z aplikací systému MDL CrossFire (přístup k databázi Beilstein). Poslední verze některých programů pro kreslení chemických vzorců již obsahují modul pro vytváření názvů pro jednoduché molekuly:
Nakreslete strukturu isatinu a nechte ho některým programem pojmenovat. Jaké je jméno přiřazené programem (a kterým)?
U3. CASSI (Chemical Abstracts Service Source Index) je důležitý pro správné pojmenování časopisů pomocí zkratky a naopak nalezení jaký je plný název časopisu, známe-li zkratku. V chemické knihovně je rovněž k dispozici "Seznam zkratek odborných časopisů" vydaný časopisem CCCC. Různé seznamy zkratek časopisů lze nalézt i na internetu, např. zde nebo i s jejich ISSN na serveru Frontiers of Bioscience. Předokládejme, že jste našli odkaz na německý časopis se zkratkou: Ber. Bunsen-Ges. Phys. Chem. Jaký je plný název časopisu? Mezi chemiky se rovněž často používají ještě (neoficiální) zkratky zkratek časopisů. Zjistěte (nebo si domyslete) co znamenají zkratky: CCCC, JACS, JOC, T, TL.